微生物肥料可以概括为三大类，一类是通过微生物的生命活动，增加职务营养元素的供应量，导致职务营养状况的改善。微生物肥料在土壤中和有害微生物相互拮抗，还能产生抗病、防病、乃至治虫的作用，用量多在每亩2公斤左右。这一类有代表性的产品有根瘤菌、固氮菌、解磷菌和硅酸盐菌（钾菌）。另一类是微生物的代谢物质，如氨基酸、黄植酸等，将它和矿质微量元素加以配合，制成液态或固态的产品，达到刺激作物圣战和抗御病虫害的作用。每亩地用量100克左右。再一类是借助微生物腐解有机质的功能，例如发酵或酵素菌，加速农家肥或秸秆的腐烂，达到增加土壤腐殖质的作用。这一类多加入等量的化学肥料，以保证作物对营养的需求。市场上叫多元有机肥。比如“em有益菌群。微生物肥料可用于拌种、浸种、蘸根、做底肥、追肥，沟施或穴施。但以拌种最为简便经济、有效。其拌种方法是先将固体菌肥加清水调至糊状或液体菌剂加清水稀释，然后与中子充分搅拌，稍晾干后播种，并立即覆土。

　　有的菌肥也可以和化肥同时拌用作底肥。微生物肥料是生物活性肥料，因此有特定的施用要求。

一是避免开袋后长期不用。开袋后长期不用，其他菌就可能侵入袋内，使微生物菌群发生改变，影响其使用效果。

二是避免在高温干旱条件下使用。在高温干旱条件下，生存和繁殖就会受到影响，不能发挥良好的作用。应选择阴天或晴天的傍晚使用这类肥料，并结合盖土、盖粪、浇水等措施，避免微生物肥料受阳光直射或因水分不足而难以发挥作用。

三是避免与未腐熟的农家肥混用。这类肥料与未腐熟的有机肥堆沤或混用，会因高温杀死微生物，影响微生物肥料的发挥。同时也要注意避免与过酸过碱的肥料混合使用。

四是避免与农药同时使用。化学农药都会不同程度地抑制微生物的生长和繁殖，甚至杀死微生物。若需要使用农药，也应将使用时间错开。不能用拌过杀虫剂、杀菌剂的工具拌微生物肥料。

三有机肥的堆沤腐熟的科学施用方法有机肥的堆沤腐熟与施用在堆沤未腐熟的有机肥时，堆肥场地要选在背风、向阳、地势高燥的地方，在堆肥地面铺农膜或选水泥地面，要将农家肥中的畜粪结块打碎，秸秆要铡碎在5厘米以下进行碾压，并要混入约3％左右的过磷酸钙和粪土翻匀后进行堆积。加入过磷酸钙主要是防止有机肥中的氮素流失，并能增加微生物的活动。堆制好后把表面用铁锨拍平，用泥抹10厘米左右厚或用农膜覆盖，四周压严，制造缺氧环境，使之尽快腐熟。农家肥堆60天左右即可腐熟。

当有机肥颜色由原来的灰色变成紫色、黑色，质地松散，有恶臭味时，说明已经腐熟，要及时施入果园。把充分腐熟的有棚巴施入果园时，应选择树冠垂直投影下以外部位，开挖宽30-40厘米、深30-40厘米的施肥沟，将有机肥与适量化肥（氮、磷肥）和表土混均匀后投入施肥沟底，最后用翻出的底层生土覆盖，或进行全园撒施，撒施后翻入土层。

四微肥科学施用方法微肥是微量元素肥料的简称。在生产上,人们往往只重视氮、磷、钾三大元素肥料的施用,忽视铁、铜、锌、硼、钼、锰等微量元素的使用。实践证明,微量元素肥料是不能用“三要素”肥料来代替的,如果土壤中尽管大量元素充足,而缺乏某一种微量元素,作物就不能正常生长发育,甚至出现生理性病害症状,严重时将不可救药而导致死亡。因此,在增施氮、磷、钾肥料后,还要注意作物的生理表现,及时断定作物出现的缺素症。作物只需少量微肥就可以满足正常生长的需要,但各种微肥从缺乏到过量的临界范围是很小的,同时微肥不是在任何作物和土壤上都有效,施用时有高度的针对性和选择性,稍有缺乏或过量就可造成对作物严重的危害。

正确的施用技术是提高微肥施用效果的关键。

1.要严格控制微肥施用量。微肥用量过大对作物会产生毒害作用,而且还可能污染环境和危害人、畜健康。因此要严格控制微肥用量,力求施用均匀。

一般微肥可与氮、磷、钾肥拌匀后施用,避免局部浓度过高的危害。根外喷施微肥时,浓度要适宜,不可随意增加用量或提高浓度,如确需要高浓度时,以不超过规定浓度的20%为限。以免造成毒害作用。

2.要配合增施有机肥料。实践证明,增施有机肥料能大大提高施用微肥的效果,因为增施有机肥料既能增加土壤的有机酸,使微量元素呈可利用状态,同时又在微肥过量时,能缓解微肥毒性。况且有机肥本身就含有数量较多、种类齐全的微量元素。

在微肥缺乏地区尤要注意加大有机肥料的施用量。

3.要配合施用氮、磷、钾等大量元素。虽然微量元素和氮、磷、钾三要素都是同等重要和不可代替的营养元素,但在农业生产中还是应首先满足作物对大量元素的需要,只有在施足大量元素的基础上,微量元素的效果才能充分发挥出来。如果忽视了大量元素肥料的施用,一味依靠微肥发挥作用是不科学的。微肥必须在氮、磷、钾等大量元素满足的重要条件下,才会表现出明显的促熟增产作用。如微量元素充足,而大量元素保持常量,则大量元素将成为促熟增产的限制因素。

4.要因作物和土壤制宜,合理施用。首先各种作物对不同的微肥有不同的反应,施用时要根据作物对微肥的敏感程度,确定施用量。

需硼较多的作物有大白菜、萝卜、向日葵、豆科作物、油菜、甘蓝和烟草等,大多数谷类作物因对硼不敏感故需硼较少;需锰较多的作物有马铃薯、大豆、甘薯、洋葱、菠菜、莴苣等;需锌较多的有玉米、水稻、大豆、番茄、柑橘、桃等;需钼较多的是豆科作物和十字花科作物;缺铁则多发生在梨、桃等多年生果树上。其次由酸性火成岩发育而成的黄、红壤,硼、锌、钼等微量元素较为缺乏,在生产上应有针对性施用这些微肥。此外作物在合理轮作、增施有机肥料的条件下,一般不易发生微量元素缺乏症,因此施用微肥要有针对性,亦应因地因作物制宜,对多年生植物(果树等)和多年连作的地块(保护地蔬菜等),要注意缺素的表现。在一地区某元素的丰缺,要经分析和试验来确定,只有针对性地施用所缺少微肥,才能提高施用效果,达到促熟、增产的目的。

5.要根据不同需要选用不同的施用方法。微量元素肥料的施用方法很多,有土壤施肥、种子处理和根外追肥等。土壤施肥:即做基肥、种肥或追肥时把微量元素肥料施入土壤。这种施法虽然肥料的利用率较低,但有一定的后效。含微量元素的工业废弃物和缓效性微肥常采用这种施肥方法。种子处理:包括浸种和拌种两种方法。